程序聚合 软件案例 虚拟筛选分子对接-分子对接

虚拟筛选分子对接-分子对接

2025-12-06 15:40:33
行业:医疗健康、云计算
载体:爬虫/脚本、插件
技术:Python、SQL

业务和功能介绍

构建“爬虫-清洗-对接-落地”全自动化蛋白结构计算管线:1) 定时爬虫并行拉取PDB最新晶体结构与AlphaFold全蛋白质组预测模型,增量更新、MD5校验、断点续传,夜间带宽空闲时段跑满10 Gbps;2) Python层调用PDBFixer、Biopandas与OpenMM,批量去氢原子、去水分子、补全缺失侧链、修复异常二硫键,输出标准PDB或PDBQT,同时生成质量报告(Ramachandran、MolProbity分数)写入MySQL;3) 将净结构与千万级配体库(ChEMBL、ZINC、Mcule)推送至AWS/GCP/阿里云对象存储,触发Serverless函数自动切分任务,Slurm/Kubernetes GPU集群弹性伸缩,调用Vina-GPU、GNINA、DiffDock多引擎并行分子对接,实时回传结合能、RMSD、相互作用指纹;4) 结果经ETL进入数据仓库,BI大屏可视化,对接国家自然基金、重点研发计划及药企合作课题,自动生成英文实验记录、可交付文档与注册申报素材,已在三个科研院所、五个新药发现项目中落地,累计筛选苗头化合物2000+,体外验证命中率提升3.8倍,实现“0-1”科研转化闭环。

项目实现

项目已在中国科学院上海药物研究所、浙江大学药学院及粤港澳大湾区精准医学研究院三地同步落地,形成“数据-算力-算法-实验”闭环。系统上线6个月,累计自动爬取并清洗蛋白结构3.2万个,完成4200万配体-靶点对接计算,筛选出活性<10 μM苗头化合物187个,其中11个进入酶学/细胞水平验证,命中率较传统虚拟筛选提高3.8倍。平台支持一键生成符合IND申报格式的计算报告,助力3项国家新药创制重大专项、2项企业横向课题通过中期评估,直接节省实验成本约860万元,获批软件著作权2项、申请发明专利3件,实现科研成果向临床前候选药物的高效转化。

示例图片视频


前大厂程序员吴
30天前活跃
方向: 人工智能-机器学习与深度学习、
交付率:100.00%
相似推荐
智能多端协同平台-yinglong智能系统
立项背景和目标 本项目旨在构建一个集智能对话、自动化信息处理、终端远程控制于一体的业务中台。解决企业日常运维、信息采集、多系统协同中的重复性劳动问题,通过AI技术实现部分环节的无人值守。 2、核心功能模块 AI对话与推理模块:基于大语言模型的智能问答与决策支持,可辅助业务分析。 浏览器自动化模块:模拟用户操作网页,自动完成数据抓取、表单提交等任务。 情报API服务:对外提供结构化数据接口,支持第三方系统集成。 终端远程管理模块:通过WebSocket实现远程服务器命令执行与日志查看。 主控调度中心:统一管理各模块的任务队列、健康检查和异常告警。 3、业务流程 用户通过前端界面(或API调用)提交任务请求 → 主控中心解析任务类型 → 分发给对应的AI/自动化模块执行 → 结果存入Redis缓存并同步MySQL持久化 → 最终返回给用户。整个过程支持异步和同步两种模式。
包装袋生产日期检测
一、立项背景和目标 在现代工业化高速包装产线上,喷码漏印/错印/重印以及包装破损、封口不良等缺陷严重影响出厂合格率,传统人工抽检方式效率低、易漏检且无法做到全检。本项目面向高速自动化流水线,构建了一套“工业级 OCR 生产日期识别与表面缺陷在线智能质检系统”,实现包装表面特征毫秒级全检,并与产线 PLC 控制系统无缝联动,实现残次品 100% 自动定位与精准剔除。 二、软件功能与核心功能模块 1. 工业相机触发与高速图像采集模块:支持光电传感器外部硬件触发(Hard Trigger),实现微秒级曝光同步抓拍高速运动工件。 2. 喷码字符定位与 OCR 文本解析引擎:自适应定位生产日期、批号、保质期等变动喷码区域,执行多角度倾斜矫正、字符分割与高精度内容识别,并与生产工单标准文本实时核对校验。 3. 包装表面与封口缺陷检测模块:结合形态学与深度学习分割算法,实时识别包装漏液、褶皱、划痕、压边残缺及喷码模糊等外观缺陷。 4. PLC 通信与气动剔除协同模块:集成工业总线/串口通信协议,将检测判废结果与编码器脉冲位置同步传递给下位机 PLC,驱动气动电磁阀/机械推杆完成剔除动作。 三、业务流程与功能路径 工件流经检测工位 -> 光电信号触发工业相机抓拍高清图像 -> 图像处理流水线执行字符 OCR 结构化比对与表面缺陷检测 -> 综合判定工件良品/不良品等级 -> 判定为 NG 时通过工业通信协议向 PLC 发送剔除信号与编码器追踪位移 -> 机械剔除机构在指定位置将废品吹出/推入废品箱 -> 实时记录检测报表与瑕疵原图归档。
工作状态监测
一、立项背景和目标 在数字化工位管理、智慧办公与特种作业安防场景中,传统考勤系统仅能记录出入打卡,无法实时感知员工在岗状态及异常作业行为。本项目基于瑞芯微高性能边缘计算平台 RK3588,构建一套边缘侧低功耗、高实时性的“人脸识别与工作状态智能监测系统”,实现无感身份核验、在离岗检测及专注度/违规作业状态的边缘端一体化实时分析。 二、软件功能与核心功能模块 1. 高性能视频流采集与预处理模块:支持多路 RTSP/MIPI-CSI 高清工业摄像头视频流接入,利用硬件编解码单元(MPP)完成硬解与图像色彩空间转换(RGA)。 2. 边缘端人脸识别与活体检测模块:基于深度学习模型实现人脸快速检测、关键点对齐、RGB+红外双目静默活体防伪及本地特征库千万级特征向量秒级比对。 3. 工作状态与行为分析引擎:结合人体姿态估计与工位 ROI 区域检测,实时分析在岗/离岗时长、低头玩手机、脱岗疲劳打瞌睡及异常离席等工位状态。 4. 告警联动与边缘数据上报:支持状态异常事件触发抓拍、本地低延时告警,并通过 MQTT/HTTP 将脱敏状态数据结构化上报至企业中台。 三、业务流程与功能路径 摄像头实时输入视频流 -> RK3588 硬件解码与 RGA 图像裁剪缩放 -> NPU 驱动执行人脸识别算法完成身份绑定 -> 并行推理工位人体姿态与行为检测模型 -> 业务逻辑状态机聚合判定工位状态 -> 触发本地声光/日志告警并异步上报管控后台。
AI量体裁衣(日本公司外包项目)
一、立项背景和目标 传统西装高级定制高度依赖人工线下精准量体,存在服务门槛高、流程繁琐且难以实现规模化线上服务的问题。本项目旨在构建一套基于图像的“AI智能量体裁衣与穿搭顾问系统”,用户仅需上传全身照片,即可全自动解算西装定制所需的关键人体围度与骨骼几何数据,并依托智能体生成定制化穿搭与版型建议。 二、软件功能与核心功能模块 1. 图像采集与预处理模块:支持用户正面/侧面全身图像输入与图像质量自动化校验。 2. AI视觉量体计算引擎:集成人体关键点检测与三维人体参数化模型重构,精准拟合躯干网格并解算出肩宽、胸围、腰围、臀围、袖长、裤长等西装核心剪裁指标。 3. Coze AI穿搭咨询与决策工作流:将解算的量体数据、身形比例特征通过API传递给智能体,智能输出版型选择(修身/标准/宽松)、面料色彩及场合穿搭策略。 4. 服务端API与工作流协作:提供高并发服务端接口,实现图像上传、算法解算、结果回传与穿衣报告生成的全链路闭环。 三、业务流程与功能路径 用户上传人体图像 -> 系统调用人体检测与3D Mesh重构管线计算三维点云与骨骼关键点 -> 计算西装定制各项围度与长度参数 -> 结构化数据接入Coze智能体API工作流 -> 生成包含“精准量体数据 + 智能西装穿搭建议”的综合报告。
改进ProGAN的小样本纹理生成系统
1. 立项背景和目标: 针对传统ProGAN在生成高分辨率纹理时存在的模式崩塌、细节模糊及训练不稳定性问题,本项目旨在构建一套高保真纹理生成系统。目标是通过算法优化,实现4K级无缝纹理的自动化生成,解决游戏与影视制作中美术资产生产效率低、重复度高的问题,将单张高质量纹理的生产时间从数小时缩短至分钟级,并显著提升生成结果的多样性与真实感。 2. 软件功能、核心功能模块的介绍: 系统包含三大核心模块: 改进型生成对抗网络核心:引入自适应实例归一化与谱归一化技术,优化ProGAN的渐进式增长策略,增强高频细节表现力; 纹理后处理与优化模块:集成超分辨率重建与色彩校正算法,自动修复生成瑕疵,支持PBR材质贴图(法线、粗糙度等)的一键导出; 交互式评估看板:提供FID/IS指标实时监控与人工偏好反馈接口,支持用户通过文本或草图引导生成方向。 3. 业务流程、功能路径描述: 用户输入参数或参考图→系统初始化噪声向量→进入改进的ProGAN渐进式生成流程(从低分辨率逐步上采样至目标分辨率)→经过判别器多尺度校验→输出基础纹理→通过后处理模块增强细节→最终交付高清无缝纹理资产并自动归档。
帮助文档   Copyright @ 2021-2024 程聚宝 | 浙ICP备2021014372号
人工客服